Os Termos de Compromisso de Gestão são um instrumento novo de gestão do MCT e consistem em acordos firmados entre o Ministério e cada Unidade de Pesquisa, nos quais são estabelecidas metas a serem atingidas durante o ano, traduzidas em indicadores mutuamente pactuados. Essa nova forma de relacionamento MCT/UP foi implantada a partir das recomendações indicadas pela denominada "Comissão Tundisi", no Relatório " Proposta de Política de Longo Prazo para as Unidades de Pesquisa vinculadas ao Ministério da Ciência e Tecnologia".