Outorgada pelo Presidente da República, destina-se a premiar pessoa jurídica que realiza serviço ou trabalho de relevância no campo da Ciência e Tecnologia. Confeccionada em prata, tem a efígie de José Bonifácio de Andrada e Silva.

As seguintes instituições receberam a Medalha:


ABC - Academia Brasileira de Ciências - Decreto de 15 de outubro de 1998

SBPC - Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência - Decreto de 21 de julho de 2000

Embrapa - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Decreto de 15 de março de 2005

Fiocruz - Fundação Oswaldo Cruz - Decreto de 16 de novembro de 2006

Butantan - Instituto Butantan-Decreto de 16 de fevereiro de 2007