O evento constituiu-se de cinco mesas temáticas e de seis grupos de trabalho com a finalidade de promover a discussão e análise dos temas propostos entre pessoas-chave e setores da sociedade envolvidas com o programa. Nas buscou-se enfocar o aproveitamento dos conhecimentos acumulados nas experiências para subsidiar os eixos temáticos do PAS.
Paralelamente ao seminário realizou-se a Feira de Resultados para divulgar experiências de produção sustentável apoiadas pelo Programa Piloto na Amazônia.