Linha Temática 1: Manejo Integrado de Ecossistemas Terrestres e Recuperação de Áreas Degradadas

Subtema 1 - Conservação e uso dos recursos genéticos vegetais
Subtema 2 - Ciclos biogeoquímicos
Subtema 3 - Conservação e recuperação dos recursos da fauna
Subtema 4 - Recuperação de áreas degradadas
Subtema 5 - Produtos madeireiros e não-madeireiros

Linha Temática 2:  Manejo Integrado de Bacias Hidrográficas, Ecossistemas Aquáticos e Recuperação de Áreas Degradadas.

Subtema 6 - Qualidade da água
Subtema 7 - Biologia e ecologia de organismos aquáticos
Subtema 8 - Aqüicultura
Subtema 9 - Recuperação de áreas e sistemas degradados
Subtema 10 - Conservação e uso dos recursos pesqueiros e tecnologia de pescados