A Assessoria de Coordenação dos Fundos Setoriais - ASCOF tem por finalidade assessorar o Secretário-Executivo nos assuntos relacionados com o financiamento de programas e projetos de desenvolvimento científico e tecnológico, estabelecendo normas e procedimentos, planejar, coordenar e supervisionar estudos, divulgar calendários de chamadas públicas e outros instrumentos de seleção de propostas e coordenar a articulação com as agências do Ministério da Ciência e entidades relacionadas.