O MCT atua nas áreas de energia, que inclui hidroeletricidade, energia nuclear, recursos fósseis (petróleo, gás natural e carvão), energia renováveis (agroenergia, biomassa, biodiesel, economia do hidrogênio, eólica, solar,etc.) e recursos minerais. A implementação dessa atuação está sob a reponsabilidade da Coordenação-Geral de Tecnologias Setoriais (CGTS), lotada na  Secretaria de Desenvolvimento Tecnológico e Inovação (SETEC). A CGTS no desempenho de sua responsabilidade exerce as seguintes competências:

• planejamento, proposição, articulação, coordenação e acompanhamento de ações, programas e redes de pesquisa voltados para o desenvolvimento tecnológico e de inovação desses setores,

• apoio e fomento aos programas e ações de formação e capacitação de recursos humanos, bem como, a difusão do conhecimento científico e tecnológico nas áreas de conhecimento vinculadas à área de atuação.

• Assessoramento técnico na definição e implementação do Plano Anual de Investimentos e a gestão dos Fundos Setoriais associados à sua área de atuação.

• representação do MCT nas áreas de sua atuação em vários grupos de trabalhos, comissões, conselhos, fórum de competitividade, câmaras técnicas, e

• promoção e apoia a interação do MCT com órgãos e entidades, públicas e privadas, estratégicos para o desenvolvimento tecnológico e de inovação em empresas, no âmbito de sua áreas de atuação.

A CGTS tem sob sua coordenação a Rede Brasil de Tecnologia (RBT), o Programa de Ciência Tecnologia e Inovação para a Economia do Hidrogênio (ProH₂) e o Programa Nacional de Produção e Uso de Biodiesel (PNPB) – Desenvolvimento Tecnológico. Adicionalmente tem sob sua responsabilidade a representação do MCT no Plano Nacional de Agronergia, na Rede Nacional de Estudos Geocronológicos, Geodinâmicos e Ambientais - Rede Geochronos e na Agência para o Desenvolvimento Tecnológico da Indústria Mineral Brasileira - ADIMB.